Uso da Linguagem R para Análise de Dados em Ecologia

"Uma das coisas mais importantes que você pode fazer é dedicar um tempo para aprender uma liguagem de programação de verdade. Aprender a programar é como aprender outro idioma: exige tempo e treinamento, e não há resultados práticos imediatos. Mas se você supera essa primeira subida íngreme da curva de aprendizado, os ganhos como cientista são enormes. Programar não vai apenas livrar você da camisa de força dos pacotes estatísticos, mas também irá aguçar suas habilidades analíticas e ampliar os horizontes de modelagem ecológica e estatística."

Tradução um tanto livre de Gotelli & Ellison, 2004. A Primer of Ecological Statistics. Sunderland, Sinauer.

"A chave para entender o R é que trata-se de uma linguagem. Uma linguagem para manipular objetos"

Bill Venables

" A pergunta certa sobre uma análise em R não é se é possível fazê-la, e sim como fazê-la."

Paulo Justiniano Ribeiro

"Tudo que ensinas a uma criança, impede-a de descobrir"

Jean Piaget

Objetivos

Demonstrar o potencial de uso da linguagem R para análises estatísticas em projetos de pesquisa em ecologia.
Propiciar aos alunos o entendimento do funcionamento do ambiente de trabalho do R e de sua filosofia de análise de dados.
Tornar os alunos proficientes em algumas ferramentas básicas de análise estatístico com a linguagem R.

Instrutores

Paulo Inácio de Knegt López de Prado – Depto. de Ecologia - Instituto de Biociências - USP (São Paulo)
João Luís Ferreira Batista – Centro de Métodos Quantitativos – Depto. de Ciências Florestais - E.S.A. “Luiz de Queiroz” - USP (Piracicaba)
Alexandre Adalardo de Oliveira – Depto. de Ecologia - Instituto de Biociências - USP (São Paulo)
Rodrigo Augusto Santinelo Pereira – Depto. de Biologia - FFCLRP - USP (Ribeirão Preto)

Programa

1. Introdução: histórico e filosofia de trabalho do R, breve histórico da linguagem S e do R, exemplo de uma sessão de trabalho no R.

2. Primeiros passos: interação com programa, sintaxe e comandos, como obter ajuda.

3. Funções no R e sua Aplicação: funções matemáticas, funções estatísticas e operações lógicas.

4. Leitura e Manipulação de Dados: tipos de variáveis e de estrutura dos dados, entrada e importação de dados, transformações de dados, operações vetoriais e matriciais, indexação.

5. Análise Exploratória de Dados: estatísticas descritivas, gráficos exploratórios.

6. Modelos Lineares: lógica geral em R, regressão linear, análise de variância, verificação das pressuposições dos modelos lineares.

7. Noções de Programação em Linguagem S: fundamentos de programação orientada a objetos; lógica e controle de fluxo em linguagem S; procedimentos vetoriais de programação.

8. Simulação e Reamostragem: funções ligadas às distribuições de probabilidade, simulação de distribuições, reamostragem de dados.

9. Análises Multivariadas: introdução a análises multivariadas básicas em R

Arquivos de Dados

Alguns arquivos de dados que utilizados no curso:

Disciplina Maio de 2008

Programa e orientações preparatórias: Informações importantes para os alunos da disciplina BIE5782 - Uso da linguagem R para análise de dados em ecologia. Leia atentamente e faça as atividades indicadas antes do início das aulas.